鎌形清人

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Kiyoto KAMAGATA

所属学会

  • 日本生物物理学会
  • 日本蛋白質科学会
  • 日本生化学会
  • 日本化学会
  • アメリカ蛋白質科学会

業績リスト

原著論文

  • Subekti D. R. G., Murata A., Itoh Y., Fukuchi S., Takahashi H., Kanbayashi S., *Takahashi S., *Kamagata K., “Disordered linker in p53 participates in non-specific binding to and 1D sliding along DNA revealed by single-molecule fluorescence measurements”, Biochemistry （2017）DOI: 10.1021/acs.biochem.7b00292　
  • Agato Murata, Yuji Itoh, Eriko Mano, Saori Kanbayashi, Chihiro Igarashi, Hiroto Takahashi,  Satoshi Takahashi, *Kiyoto Kamagata“One-Dimensional Search Dynamics of Tumor Suppressor p53 Regulated by a Disordered C-Terminal Domain”, Biophysical Journal, Vol.112, Issue 11, 2301-2314（2017) 
  • Daiki Tatsumi, Kei Nanatani, Yuto Koike, Kiyoto Kamagata, Satoshi Takahashi, Ayumu Konno, Tadaomi Furuta, Minoru Sakurai, Nobuyuki Uozumi, “Probing native metal ion association sites through quenching of fluorophores in the nucleotide-binding domains of the ABC transporter MsbA”, Biochemical Journal, 474, 12, 1993-2007（2017）
  • *Kiyoto Kamagata, Agato Murata, Yuji Itoh, Satoshi Takahashi, “Characterization of  facilitated diffusion of tumor suppressor p53 along DNA using single-molecule fluorescence imaging”, Journal of Photochemistry and Photobiology C: Photochemistry Reviews, 30,36-50（2017)
  • Igarashi C., Murata A., Itoh Y., Subekti D. R. G., *Takahashi S., *Kamagata, K., “DNA garden: A simple method for producing arrays of stretchable DNA for single-molecule fluorescence imaging of DNA binding proteins”, Bull. Chem. Soc. Jpn., 90, 34-43 (2017)
  • Yuji Ito, Agato Murata,  Seiji Sakamoto, Kei Nanatani, Takehiko Wada,  *Satoshi  Takahashi, *Kiyoto Kamagata “Activation of p53 Facilitates the Target Wearch in DNA by Enhancing the Target Recognition Probability” Journal of Molecular Biology,Volume 428, Issue 14, 17 July, 2916-2930 (2016）
  • Agato Murata, Yuji Ito, Risa Kashima, Saori Kanbayashi, Kei Nanatani, Chihiro Igarashi, Masaki Okumura, Kenji Inaba, Takashi Tokino,  *Satoshi Takahashi,  *Kiyoto Kamagata “One-dimensional sliding of p53 along DNA is accelerated in the presence of Ca2+ or Mg2+ at millimolar concentrations” Journal of Molecular Biology,Volume 427, Issue 16, 14 August, 2663-2678 (2015)
  • Hiroyuki Oikawa, Kiyoto Kamagata ,Munehito Arai, and Satoshi Takahashi “Complexity of the Folding Transition of the B domain of Protein A Revealed by the High-Speed Tracking of Single-Molecule Fluorescence Time Series” The Journal of Physical Chemistry B,119(20), 6081-6091 (2015)
  • Hiroyuki Oikawa, Yuta Suzuki, Masataka Saito, Kiyoto Kamagata, Munehiro Arai and Satoshi Takahashi “Microsecond dynamics of an unfolded protein by a line confocal tracking of single molecule fluorescence” Scientific Reports 3, (2013) Article number:2151, doi:10.1038/srep02151
  •  Kamagata K, Kawaguchi T, Iwahashi Y, Baba A, Fujimoto K, Komatsuzaki T, Sambongi Y, Goto Y, Takahashi S.Long-Term Observation of Fluorescence of Free SingleMolecules To Explore Protein-Folding Energy Landscapes” J. Am. Chem. Soc. 134, 11525-11532 (2012)
  • Inobe, T., Takahashi, K., Maki, K., Kamagata, K., Kadooka, A., Arai, M., Kuwajima, K. Asymmetry of the GroEL-GroES Complex under Physiological Conditions as Revealed by Small-angle X-ray Scattering. Biophysical Journal, 94, 1392-402. (2007)
  • Kinoshita, M., Kamagata, K., Maeda, A., Goto. Y., Komatsuzaki, T., Takahashi, S. Development of a technique for the investigation of folding dynamics of single proteins for extended time periods.
    Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 104, 10453-10458 (2007)
  • Enoki, S., Maki, K., Inobe, T., Takahashi, K., Kamagata, K., Oroguchi, T., Nakatahi, H., Tomoyori, K., Kuwajima, K. The equilibrium unfolding intermediate observed at pH 4 and its relationship with the kinetic folding intermediates in green fluorescent protein. J. Mol. Biol., 361,　969-82(2006)
  • Kamagata, K., Kuwajima, K. Surprisingly high correlation between early and late stages in non-two-state protein folding. J. Mol. Biol., 357, 1647-1654 (2006)
  • Oroguchi, T., Ikeguchi, M., Saeki, K., Kamagata, K., Sawano, Y., Tanokura, M., Kidera A., Kuwajima, K. Atomically detailed description of the unfolding of alpha-lactalbumin by the combined use of experiments and simulations. J. Mol. Biol., 354, 164-172 (2005)
  • Kamagata, K., Arai, M., Kuwajima, K. Unification of the folding mechanisms of non-two-state and two-state proteins. J. Mol. Biol., 339, 951-965(2004)
  • Kamagata, K., Sawano, Y., Tanokura, M., Kuwajima, K. Multiple parallel-pathway folding of proline-free staphylococcal nuclease. J. Mol. Biol., 332, 1143-1153 (2003)
  •  Kamagata, K., Kuwajima, K. Parallel folding pathway of proline-free staphylococcal nuclease studied by the stopped-flow double-jump method. Spectroscopy-an International Journal., 17, 203-212(2003)
  • Inobe, T., Arai, M., Ito, K., Nakao M., Kamagata, K., Makio, T., Amemiya, Y., Kihara, H., Kuwajima,K. Equilibrium and kinetics of the allosteric transition of GroEL studied by solution X-ray scattering and fluorescence spectroscopy. J. Mol. Biol., 327, 183-191 (2003)
  • Kuwajima, K., Arai, M., Inobe, T., Ito, K., Nakao, M., Maki, K., Kamagata, K., Makio, T., Kihara, H., Amemiya, Y. The use of the time-resolved X-ray solution scattering for studies of globular proteins. Spectroscopy-an International Journal., 16, 127-138 (2002)
  • Arai, M., Inobe, T., Ito, K., Nakao, M., Maki, K., Kamagata, K., Makio, T., Kihara, H., Amemiya, Y. Kuwajima, K. Fast compaction of alpha-lactalbumin during folding studied by stopped-flow X-ray scattering” J. Mol. Biol., 321, 121-132(2002)

総説 ＆著

  • Satoshi Tkahahshi, Kiyoto Kamagata, Hiroyuki Oikawa
    “Where the complex things are: single molecule andensemble spectroscopic investigations of protein folding dynamics”
    Current Opinion in Structural Biology, volume 36, 1-9, 2016　
  • 村田崇人・伊藤優志・鎌形清人
    「DNA結合蛋白質p53のスライディング探索の単分子蛍光観察」
    生物物理56 (2), 109-111, 2016　
  • 小井川浩之・鎌形清人・高橋聡
    「揺らぎ・ダイナミクスと生体機能～物理化学的視点から見た生体分子～」4.1,　4.2節
    化学同人　（2013年9月）
  • 鎌形清人　新規一分子蛍光観察法による蛋白質の構造変化の可視化
    化学と生物 vol.51, No.1 ,　22-27　（2013年1月）
  •  鎌形清人　若手研究者から「生物物理の未来に寄せて」新技術によるタンパク質研究の新展開
    生物物理52（2）,　104-105　（2012年4月）
  • Satoshi Tkahashi and Kiyoto Kamagata
     “Staring at a Protein : Ensemble and Single-Molecule Inbestigations on Protein-Folding Dynamics”
    Single-Molecule Biophysics : Experiment and Theory, Advances in Chemical Physics, Volume 146.(2011.11)
  • 小井川浩之・鎌形清人・高橋聡　
    「一分子蛍光観察法を用いたタンパク質フォールディングの解明～Single Molecule Observation on the Folding Process of Proteins～」高分子Vol.60 （2011)
  • 鎌形清人・高橋聡「新しいタンパク質科学の可能性-新時代を切り拓くマルチタレントDavid Baker-」
    化学　化学同人（2011）
  • 鎌形清人、木下雅仁、高橋聡「新規一分子測定法による蛋白質の折り畳み運動研究：超複雑なシステムへの挑戦」生物物理 (2009)
  • 高橋聡, 鎌形清人「蛋白質を基板から解き放つ：蛋白質の折り畳み運動の解明を目指した一分子観察法の開発」
    BIOINDUSTRYシーエムシー出版, 299, 7-14 (2009)
  • 鎌形清人、桑島邦博「蛋白質フォールディング速度と構造パラメータとの相関解析」生物物理、46, 　144-149 (2006)
  • Maki, K., Kamagata, K., Kuwajima, K.”Equilibrium and kinetically observed molten globule states (review) ” In Protein Folding Handbook (Buchner, J. and Kiefhaber, T. eds.) WILEY-VCH, 852-879, (2005）

 受賞歴 

  • 2008年度日本蛋白質科学会年会・若手奨励賞

その他の活動

  • 鎌形清人・間野絵梨子・高橋聡、”高校生のためのサイエンス体験　柔らかな分子を観察しよう
    ”「顕微鏡でDNAの柔らかな動きを見てみよう」”    （2015年7月11日　日本科学未来館）
  • 鎌形清人（制作ワーキンググループメンバー）、”文部科学省「一家に１枚　動く！タンパク質」ポスター”
    詳細はこちら  （2014年）
  • 鎌形清人（研究会座長）、”日本生物物理学会　東北支部会2012”　（2012年12月17日　東北大学片平キャンパス）
  • 鎌形清人・間野絵梨子・高橋聡（討論会実行委員）、”第３９回生体分子科学討論会”（2012年6月8～9日　東北大学片平さくらホール）
  • 鎌形清人・高橋聡（東北支部支部長）”日本生物物理学会　東北支部講演会”（2011年6月17日　東北大学片平キャンパス）
  • 鎌形清人・高橋聡（年会実行委員）”第４８回日本生物物理学会年会”（2010年9月20～22日　東北大学川内キャンパス）
  • 鎌形清人・高橋聡 ”蛋白質の基質結合や構造変化における分子揺らぎの意義を討論する会”（2010年3月4～5日　東北大学片平キャンパス）